Llawlyfr Defnyddiwr iMed
Rhagymadrodd
1.1. Pwrpas
Pwrpas hyn web cais yw cymryd gwybodaeth amrwd a chaniatáu ei thrin mewn modd sy'n rhoi canlyniadau defnyddiol wrth wneud penderfyniadau. Gall hyn fod i hyfforddi model gyda data crai neu ragfynegi'r canlyniad gan ddefnyddio modelau a dadansoddiadau.
1.2. Bwydlen Mordwyo
Mae'r ddewislen llywio ar frig y dudalen yn dal yr holl ddolenni i gyrraedd lle mae angen i chi fod. Os byddwch chi byth yn mynd ar goll, gallwch chi bob amser glicio ar y saeth gefn i gyrraedd tudalen gyfarwydd, mynd yn ôl adref, neu ddod o hyd i'r dudalen rydych chi'n chwilio amdani o fewn y ddewislen llywio.
1.3. Cyfrif
Os nad oes gennych gyfrif yn barod, rhaid i chi gofrestru i ddefnyddio'r cais. I wneud hynny, cliciwch ar y botwm cyfrif ar y dde uchaf a chliciwch gofrestru. Yna rhowch eich enw defnyddiwr, cyfrinair, ac e-bost i symud ymlaen.
Os oes gennych gyfrif yn barod, mewngofnodwch gyda'ch enw defnyddiwr a'ch cyfrinair.
Tudalen Gartref
Wrth glicio ar yr eitemau ar ochr chwith y dudalen, bydd disgrifiad o bob un yn ymddangos ar ganol y dudalen i'ch helpu i ddeall beth mae pob un yn ei wneud.
iMedBot
Mae'r cymhwysiad iMedBot yn cyflwyno rhyngwyneb sy'n meithrin rhyngweithio hawdd rhwng defnyddwyr ag asiantau, gan alluogi rhagfynegiad personol a hyfforddiant model. Mae'n gweithredu fel y cam cyntaf tuag at drawsnewid canlyniadau ymchwil dysgu dwfn yn offeryn ar-lein, sydd â'r potensial i sbarduno gweithgareddau ymchwil ychwanegol yn y maes hwn. Gellir dod o hyd i'w llawlyfr defnyddiwr priodol yma.
Dadansoddi Data
4.1. Adalw Is-setiau
Mae'r adran hon yn gadael i'r defnyddiwr olygu ei set ddata. Gallwch ddewis naill ai uwchlwytho set ddata newydd neu ddefnyddio un sy'n bodoli eisoes o'r gwymplen.
Unwaith y bydd y set ddata wedi'i llwytho i fyny, gallwch ddewis pa gamau yr hoffech eu cymryd trwy glicio ar un o'r opsiynau ar y ddewislen ochr chwith.
4.1.1. Adalw Is-setiau yn Seiliedig ar Hidlau
Mae'r adran hon yn caniatáu cael is-set lai o'r set ddata wreiddiol yn seiliedig ar hidlwyr penodol. Dewiswch y gwerthoedd rydych chi eu heisiau yn yr is-set ac yna dewiswch y colofnau rydych chi am eu dangos yn y set ddata derfynol.
4.1.2. Dychwelyd Canlyniadau wedi'u Trefnu
Mae hyn yn dychwelyd y set ddata mewn ffurf wedi'i threfnu. Dewiswch y golofn darged, trefn ddidoli, nifer y rhesi i'w dychwelyd, a pha golofnau i'w dangos yn yr allbwn terfynol.
4.1.3. Ehangu'r Set Ddata
Mae hyn yn galluogi'r defnyddiwr i ehangu colofn unigol sydd wedi'i storio fel geiriadur i mewn i dabl gwirioneddol y gall y defnyddiwr wedyn ei drin. Mae'n cymryd set ddata nythu ac yn symud yr hyn sydd ei angen ar y defnyddiwr i'r haen uchaf. Yn gyntaf, uwchlwythwch set ddata sy'n cynnwys colofn gyda set ddata nythu. Os canfyddir colofn y mae angen ei hehangu yn awtomatig, dewiswch pa golofn i'w hehangu a pha golofnau i'w tynnu o'r wybodaeth nythu. Cliciwch cyflwyno a gallwch chi view eich gwybodaeth fel colofnau o dabl yn lle data nythu.
4.2. Uno Files
Trwy ddewis a lanlwytho setiau data lluosog trwy glicio ctrl (gorchymyn ar gyfer mac), bydd hyn yn eu huno i mewn i un set ddata fwy nag a ddefnyddir ar gyfer rhywbeth arall.
Dewiswch yr holl setiau data a llenwch y wybodaeth ofynnol. Bydd hyn yn arbed y set ddata newydd i'r cymhwysiad iMed ac yna ar gael i'w lawrlwytho.
4.3. Swyddogaethau Plot
Mae'r adran hon yn gadael i'r defnyddiwr blotio ei set ddata. Dewiswch un o'r opsiynau ar y ddewislen ar yr ochr chwith ac yna llenwch y meysydd gofynnol i gael eich plot. Isod mae'r mathau o blotiau y gallwch eu gwneud o'ch data:
4.4. Dadansoddiad Ystadegol
Mae'r adran hon yn gadael i ni gynnal profion ystadegol ar ein set ddata. Dewiswch brawf i'w redeg o'r ddewislen ochr chwith a llenwch y meysydd i redeg y profion. Isod mae'r mathau o brofion sydd ar gael:
ODPAC
5.1. Dysgwch
Mae'r dudalen hon yn cynnwys disgrifiad byr o bob math o adnodd sydd ar gael ar y dudalen hon. Bydd clicio ar y botwm ar frig pob adran yn cysylltu â thudalen arall gan ganiatáu i'r defnyddiwr ddefnyddio neu ddysgu mwy am y pwnc.
5.1.1. Epistasis
Mae'r dudalen hon yn gadael i ni ddefnyddio MBS, algorithm chwilio i ddysgu o ddata. Yn benodol, mae'n ein galluogi i astudio epistasis, y rhyngweithio rhwng dau neu fwy o enynnau sy'n effeithio ar y ffenoteip. Mae hyn yn ddefnyddiol i profile afiechydon yn yr agwedd enetig. Nid yw dulliau confensiynol yn addas i drin y data dimensiwn uchel a geir mewn astudiaethau cysylltiad genom-eang (GWAS). Mae'r algorithm Chwilio Trawst Lluosog (MBS) yn caniatáu canfod genynnau sy'n rhyngweithio yn gyflymach o lawer. Llwythwch y data rydych chi am ei ddefnyddio i fyny ac yna mewnbynnwch y meysydd gofynnol. Am ragor o wybodaeth fanwl, dewch o hyd i'r papur llawn yma.
5.1.2. Ffactorau Risg
Mae'r dudalen hon yn gadael i ni ddefnyddio'r pecyn IGain i ddysgu rhyngweithiadau rhwng data. Mae'n dysgu rhyngweithiadau yn benodol o ddata dimensiwn uchel gan ddefnyddio chwiliad hewristig. Mae'r dull hwn yn adeiladu ar y dull Exhaustive_IGain a ddatblygwyd yn flaenorol i ddysgu rhyngweithiadau o ddata dimensiwn isel. Llwythwch y data i fyny ac yna mewnbynnu'r meysydd gofynnol. Mae rhagor o wybodaeth am drothwyon GG ac iGain ar gael yma.
5.1.3. Modelau Rhagfynegi
Mae'r adran hon yn caniatáu defnyddio modelau rhagfynegi sydd eisoes wedi'u hadeiladu ar ben modelau dysgu peirianyddol er mwyn hwyluso'r defnydd ohonynt. Mae hyn yn caniatáu eu defnyddio heb ddefnyddio codio a phrofiad blaenorol i ragfynegi modelau gan ddefnyddio eu set ddata eu hunain. Mae yna nifer o fodelau rhagfynegi ar gael i'r defnyddiwr gan gynnwys Logisteg, Atchweliad, Peiriannau Fector Cymorth (SVMs), Coed Penderfyniadau, a llawer mwy. Mae'r rhestr lawn o ddulliau rhagfynegi i'w gweld ar ochr dde'r dudalen yma.
5.2. Rhagfynegiad
Mae'r adran hon yn caniatáu rhagfynegiadau o fodel a rennir a uwchlwythwyd yn flaenorol. Yn gyntaf uwchlwythwch fodel a rennir os nad yw wedi'i wneud eisoes. Yna dewiswch y model i'w ddefnyddio ar gyfer rhagfynegiad trwy glicio ar enw'r model. Yna uwchlwythwch y data i'r model rhagfynegi ei ddefnyddio. Gellir gwneud hyn naill ai â llaw gan ddefnyddio'r ffurflen ar waelod y dudalen neu ddefnyddio'r templed sydd ar gael i'w lawrlwytho. Os ydych chi'n defnyddio'r templed, uwchlwythwch y set ddata file a chliciwch cyflwyno i dderbyn y rhagfynegiad model.
5.3. Cymorth Penderfyniad
Mae cymorth penderfynu yn darparu dosbarthiad a gall arwain dewisiadau triniaeth o'r wybodaeth a ddarperir i'r system. Mae wedi'i hyfforddi o ddata i argymell y weithdrefn driniaeth optimaidd yn seiliedig ar nodweddion claf. Mae rhagor o wybodaeth am Systemau Cefnogi Penderfyniadau Clinigol (CDSS) ar gael yma.
Mae Argymhelliad y System yn cymryd nodweddion claf ac yn argymell triniaeth ac yn rhagweld tebygolrwydd metastasis 5 mlynedd yn y dyfodol. Mae'r Ymyrraeth Defnyddiwr yn cymryd nodweddion y claf a'r weithdrefn driniaeth i ragfynegi'r tebygolrwydd o fetastasis 5 mlynedd yn y dyfodol yn seiliedig ar driniaeth gyfredol yn lle'r driniaeth optimaidd.
MBIL
Mae Blanced Markov a Dysgwr Ffactor Risg Rhyngweithiol (MBIL) yn algorithm sy'n dysgu ffactorau risg unigol a rhyngweithiol sy'n dylanwadu'n uniongyrchol ar ganlyniad claf. Cliciwch “ewch i MBIL” i gael eich ailgyfeirio i'r Mynegai Pecyn Python (PyPI) ar gyfer y pecyn MBIL sydd wedi'i leoli yma. Mae rhagor o wybodaeth am MBIL ar gael yn BMC Biowybodeg.
Setiau data
Mae'r adran hon yn caniatáu i'r defnyddiwr weld a llwytho setiau data newydd i'r web cais.
7.1. Gweler Pob Set Ddata Sydd Ar Gael
I weld yr holl setiau data sydd ar gael, cliciwch “Dangos Setiau Data sydd ar Gael.”
7.2. Llwythwch i fyny Set Ddata
I uwchlwytho set ddata, cliciwch "Rhannu Eich Setiau Data" ac yna llenwi'r wybodaeth ofynnol fel y nodir ar y webtudalen. Yn gyntaf, uwchlwythwch y set ddata a llenwch y meysydd gofynnol.
Yna, llenwch y meysydd isod neu uwchlwythwch destun file gyda'r wybodaeth wedi ei llenwiampRhoddir isod sut i drefnu'r wybodaeth fel y gall y cais ei deall.
Modelau
Mae'r adran hon yn caniatáu i'r defnyddiwr weld modelau sydd ar gael iddynt a rhannu model.
8.1. Gweler Pob Model sydd ar Gael
I weld yr holl fodelau sydd ar gael, cliciwch “Dangos y Modelau sydd ar Gael.”
8.2. Rhannu Model
I rannu model, cliciwch ar “Rhannu Eich Modelau” ac yna uwchlwythwch fodel file hyfforddi gan lif tensor neu PyTorch.
8.2.1. Set Ddata Cysylltiedig
Yna dylech uwchlwytho'r set ddata gysylltiedig sy'n cynnwys y penawdau. Dylai'r dosbarth/label ar gyfer y set ddata fod yn y golofn olaf.
8.2.2. Rhagfynegwyr a Gwybodaeth Dosbarth
Os yw'r set ddata yn cynnwys yr holl nodweddion, gellir hepgor y ffurflen nodwedd ar ôl uwchlwytho'r set ddata. Fodd bynnag, os nad ydynt i gyd wedi'u cynnwys, rhaid darparu'r wybodaeth hon yn y disgrifiad file neu o fewn y ffurflen nodwedd. Dewiswch yr opsiwn o'r gwymplen sy'n nodi sut rydych chi'n bwriadu darparu'r rhagfynegyddion a gwybodaeth dosbarth.
Os ydych yn defnyddio'r opsiwn disgrifio, gallwch naill ai lenwi'r meysydd neu uwchlwytho testun file gyda'r wybodaeth wedi ei llenwiampRhoddir gwybodaeth am sut i drefnu'r wybodaeth isod.
Dogfennau / Adnoddau
 |
Apiau iMed Web Cais [pdfLlawlyfr Defnyddiwr iMed, iMed Web Cais, Web Cais |